Исследователи из Колледжа ветеринарной медицины Сеульского национального университета в Южной Корее создали первый в мире эпигеномный атлас для собак, который назвали EpiC Dog (Epigenome Catalog of the Dog). Этот атлас содержит подробную информацию о том, какие гены включены или выключены в разных тканях и органах собаки. Это может помочь в будущих исследованиях по сравнительной биологии, медицине и генетике.
Собаки — уникальный объект для изучения эпигенетики, так как они делят с человеком большинство условий жизни. Кроме того, собаки имеют огромное разнообразие пород, которые были искусственно созданы человеком за последние 150 лет. Это позволяет наблюдать, как быстро происходят эпигенетические изменения под воздействием селекции и окружения.
Для создания атласа ученые собрали образцы ДНК и РНК из 11 типов тканей трех взрослых биглей: мозга, кишечника, почки, печени, легкого, молочной железы, яичника, поджелудочной железы, селезенки и желудка. Бигли были выбраны потому, что они широко используются в исследованиях рака у человека. Затем ученые провели комплексный анализ генома, эпигенома и транскриптома этих тканей с помощью современных методов биоинформатики.
С помощью атласа ученые смогли сравнить активность генов у собак, человека и мыши. Они обнаружили, что некоторые гены работают одинаково во всех трех видах. Это свидетельствует об их консервативности и важности для жизни. Другие гены имеют разную активность в разных тканях и вид ах, что отражает их адаптацию к специфическим условиям и функциям. Например, гены, связанные с иммунной системой и обонянием, оказались более разнообразными у собак, чем у человека и мыши. Это может быть связано с тем, что собаки подвергаются большему воздействию патогенов и используют обоняние для общения и поиска пищи.
Атлас эпигенома собаки EpiC Dog является ценным ресурсом для научного сообщества, так как он позволяет изучать влияние эпигенетики на здоровье, болезни и эволюцию собак и других млекопитающих. Он также может помочь в разработке новых методов диагностики, лечения и профилактики рака у человека и собак, так как они имеют много общих форм этого заболевания. Кроме того, атлас может способствовать улучшению благополучия собак, которые являются не только объектами исследований, но и любимыми домашними животными миллионов людей.
